У зоомузеї представлена фауна усіх континентів та океанів світу. Особливої уваги заслуговує колекція хижих птахів та сов (170 екземплярів), яку зібрав на поч. ХХ ст. ужгородський орнітолог-натураліст А. Грабар. Вона є однією з найкращих у Центральній Європі.
Помітне місце в експозиції займають колекції тропічних жуків та мисливські трофеї (роги) копитних тварин, що зібрав інший ужгородець — Лаудон.Щороку співробітники зоомузею проводять наметові орнітологічні табори в різних кутках Закарпаття. Підтримують робочі контакти з Інститутом зоології ім. І. Шмальгаузена НАН України (Київ), Природничим зоомузеєм НАНУ (Львів), Ужанським Національним природним парком, а також з вченими з інших країн Європи. Сьогодні музей відіграє роль Наукового центру області.