Материалы фонда и экспозиция музея размещены в 28 бывших камерах следственного изолятора. Они передают историю национально-освободительной борьбы на территории Тернопольщины.
Отдел "Репрессии 1939-1941 годов" размещается в помещении камеры №1, где сохранились автентичные двери того времени. Интересными являются материалы, которые освещают период деятельности ОУН-УПА на Тернопольщине, а также материалы "Шестидесятники", который рассказывает о репрессированных патриотах Украины, в частности В. Чорновола и Л. Костенко.
Не могут не впечатлять в экспозиции макет концлагерей, одежда и предметы быта политзаключенных, и мемориальнаяя комната С. Бандеры с его посмертной маской. Особенно шокируют помещения карцеров и камера смертников.
Предметом особенной гордости музея является разрез в натуральную величину крыивки и коллекция макетов повстанческих крыивок с интерьером. Все девять макетов сделал и подарил музею тернополчанин Илларион Пилипец.
Отдельный раздел посвящен репрессированным духовным служителям греко-католической церкви, и, в частности, Й. Слипому.